由于麝香鼠的抗病力和免疫力较强，往往养殖户在养殖当中对给药不太重视，甚至乱给药对麝香鼠的饲养造成一些不必要的损失和危害，就这些问题归纳为以下几种现象：
1 、盲目用药 有些养殖户、养殖场一旦发病就乱了方寸，对病不加以分析，就盲目用药。如：发现有呼吸道，就用治疗呼吸道的药，发现大肠杆菌就用治疗大肠杆菌的药，殊不知好多呼吸道，大肠杆菌是某些病的继发症，结果使用一次药后发现疾病没有好转，就认为此药效果不理想，紧接着就换另一种药……这样做的结果有两种：一种是侥幸治好了，但付出了很大的用药代价；另一种是贻误了治疗时机，损失惨重。因此临床上鼠群发生疾病时,一定要及时请有经验的专业技术人员确认病因，制定正确的治疗方案，对症用药，尽量减少经济损失。
2 、用药量过大 任何一种药物只要在其安全的剂量范围内使用，都能够取得良好的治疗效果。但有些养殖户认为量越大效果越好，使用时盲目加大用量，大大增加了用药成本，并且临床上因用药量过大发生中毒的案例非常普遍，这一点应引起广大养殖朋友的特别注意。
3 、用药量过小 某些养殖户出于经济上的考虑，常常将一次用的药量分成一天甚至两天用，造成剂量不足，这样的用法，不可能把病治好。再就是没考虑在制颗粒的过程中成分的损失，这些问题都是很关键的问题，一定要把损失的部分考虑到并适当加量。
4 、随意配药 临床上将两种或两种以上的药物配合在一起使用，配伍后达到预期的治疗目的是合理配伍，而两种或两种以上药物连用后给治疗带来不便或不良后果的药物配伍称为配伍禁忌（如青霉素与庆大霉素混合使用，后者会失效）。有些养殖户片面的认为，几种药物配合在一起使用就会加大其作用，因此随意的将几种药物混合在一起使用。这样用药风险很大，很容易“赔了夫人又折兵”。
5 、给药途径错误 例如有些养殖户在子鼠断乳阶段时常图省事，将只适用于注射的药物如“青霉素 ”，溶于水中供麝香鼠饮水，岂不知“青霉素 ”在水中时间太长会被分解而失去药效，从而因滥用药物而造成损失。还有将不溶解于水的药物用来给麝香鼠饮水，都是很大的误区。
6 、投药时机不当 要保证药物发挥其疗效掌握好投药时机很关键.如患呼吸道疾病的麝香鼠，当其频发咳嗽，呼吸道内有黏稠的分泌物不易咳出，此时不宜立即止咳，而应选用溶解性祛痰剂，当呼吸道分泌物不多时则应使用镇痛止咳药，同时要配合适当的抗菌消炎药以确保疗效。
由于养殖户用药的量过大或过小,药物的配伍不正确、以及其他一些不正确的使用方法等，给养殖业带来很多危害。主要有以下几个方面：
1 、表现为蓄积中毒 如氯霉素类药物，在多次或长期用药后，对骨髓造血机能引起抑制，导致血小板减少性紫瘢，粒细胞缺乏症，再生障碍性贫血和溶血性贫血等，进而影响免疫机能。再如安吉苷类抗生素庆大霉素，链霉素，卡那霉素等注射，静注给药时，主要损害听神经和肾脏。
2、表现为在一定条件下的过敏反应，如青霉素类的过敏反应，服用洛美杀星后，在强光的照射下，动物出现光敏反应等。
3、长期使用广谱抗生素，停药后出现二重感染现象。麝香鼠机体肠道内有益菌群和有害菌群同时并存，广谱抗生素将两种菌群同时杀灭，停药后其他有害菌乘虚而入，造成二次感染。如土霉素，四环素类药常常将消化道扰乱。
4 、多种药物同时使用，造成肝，肾器官解毒，排泄功能不堪重负，功能减弱或器官组织损害，特别是盲目大量重复用药危害更为严重。
因此，养殖户在养殖场发生疾病时，一定要找技术水平高，临床经验丰富的技术员及时对疾病作出准确诊断，.合理用药，使疾病造成的损失降低到最低。